Atom ERP zapewnia narzędzia wspierające każdy rodzaj biznesu, ale dla firm operujących w internecie, nakierowanych jak Atom ERP na działania on-line, system oferuje liczne dodatkowe funkcjonalności.
W zakresie handlu on-line w sieci, Atom ERP pozwala na pełną integrację sklepu internetowego z pozostałymi narzędziami i modułami systemu:
Atom ERP dla branży e-commerce może zostać rozszerzony o moduł zapewniający pełne wsparcie obsługi sprzedaży on-line, włącznie z zarządzaniem treściami na takiej stronie. Jedno narzędzie, do zarządzania całą firmą - oczywiście z zadaniami delegowanymi na konkretnych użytkowników według ich ról i zdefiniowanych dla nich dostępności poszczególnych funkcjonalności. Można więc w systemie wytypować osobę odpowiedzialną za część merytoryczną sklepu, za część księgową czy magazynową.
Atom ERP z narzędziami wspierającymi handel w internecie to potężne narzędzie zapewniające analitykę biznesową, wsparcie obsługi klienta, zarządzanie jakością, gospodarkę magazynową i księgowość zoptymalizowane pod kątem zastosowań e-commerce.